В Институте представлены четыре направления подготовки: «Зарубежное регионоведение», «Конфликтология», «Социология» и «Регионоведение России». Ключевые научные направления: идентичность в полиэтничном регионе; социальные и гуманитарные технологии профилактики и противодействия социальной агрессии, экстремизму и терроризму; кавказоведение; миграционные процессы; евразийские геополитические исследования в контексте глобализации; гендерные исследования; диагностика, моделирование и прогнозирование социальных конфликтов; социальная диагностика. На базе ИСиР ежегодно проводятся научные и научно-практические конференции и форумы: ежегодный международный форум историков-кавказоведов, ежегодный научно- просветительский форум «Мир Кавказу», ежегодные международные гендерные чтения, ежегодный всероссийский конфликтологический форум и другие. ИСиР тесно сотрудничает с Варшавским университетом (Польша), Ереванским государственным университетом (Армения), Институтом прикладных этнополитических исследований Казахстана, Национальным центром научных исследований Франции, Тракийским университетом (Болгария), Ягелонским университетом (Польша), Академией экономического образования (Молдавия). Благодаря высокой публикационной и академической активности ученых и преподавателей Института социологии и регионоведения, Южный федеральный университет входит в престижный предметный рейтинг лучших университетов мира в области Наук об обществе (Social Sciences) международного рейтинга Times Higher Education.